未来的地球陷入了一片混乱之中，社会秩序愈发地分崩离析，因为地球上出现了越来越多异能者（拥有超自然能力的人类），这些异能者中的相当一部分利用自己的超能力疯狂犯案，掠夺资源，从事不法活动，为了对付这部分异能者，人类成立了“X计划事务管理局”。
在一座繁华都市中，少年侦探秦铭轩，联合自己的伙伴拥有变身能力的少女唐雨筱、拥有疾速能力的少年剑客陆伯离等人成立了一家专门破解异能者凶案的侦探事务所“宿元侦探社”，来破解这些涉及超能力的奇案，但该侦探社一直毫无进展。直到有一天因为一个名为苏雪萱的神秘女人的到来，彻底打破了平静，宿元侦探社正式全面出击。在一起起的谜案破解过程中，一个庞大阴谋计划开始浮出水面，众人开始慢慢了解到异能者最初诞生的真相与原由，而秦铭轩特有的超能力也开始逐渐显现出来。
