神秘的外星文明于3万年前的旧时器时代晚期降临地球，然后以自身科技为基础，利用原始人的“精神”构建起了一个名为「虚数世界」的平行世界。
随后，人类中开始出现拥有神奇力量的少女，各种怪物也开始出现。
3万年后，外星文明的计划进入新的阶段，但发生了不算意外的意外，把一个异界少年的意识召唤了过来，并让他成为了一只萝太的第二人格。
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“既然穿越了，那么总得做出一些成绩来才可以。”怀抱着这等雄心壮志，李华“主动”替主人格揽下繁琐的学习任务，成为了每天按时上课和完成作业的普通国中生。
（剧情将贯穿《魔法少女小圆》所有外传漫画+TV本篇故事。）
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