自Dr.ElizabethWeir死后9年，亚特兰蒂斯城的探险队员们在Maj.JohnSheppard的带领下，将所有可能对人类产生的威胁（敌人）都击败了，飞马座也真正成为人类探险的天堂。许多地球上的有钱人、企业家、银行家、探险家、科学家纷纷通过星门大桥来到飞马座。由于没有了Wraith之类的威胁，人类骨子里的探险的基因被彻底的激发，人人都想成为哥伦布之类的伟人，科技也随之迅猛发展。终于有一天，在全人类的共同努力下，亚特兰蒂斯城的姊妹城：旭日城被建造完成；新组建的探险队决定驾驶着新的旭日城，由10艘X－304的改装版E－A01飞船护航，飞离飞马星座，去比邻的仙女星座继续探险。
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